Le catalogue informatisé de la bibliothèque est accessible sur Swisscovery.
La bibliothèque est constituée :
- des imprimés publiés suite à la consultation des archives;
- des publications des services de l'administration cantonale et des communes genevoises;
- d'ouvrages concernant l'histoire de Genève et de sa région, l'histoire du protestantisme, les sciences auxiliaires (en particulier l'archivistique), ainsi que d'ouvrages de référence plus généraux;
- d'articles sur les mêmes sujets sélectionnés dans des revues spécialisées, recueils ou actes de colloques;
- de plusieurs collections importantes de brochures genevoises (Girod, Rigaud-Naville, Le Fort, ...);
- d'un exemplaire des publications subventionnées par le Fonds de soutien à l'édition de l'État de Genève;
- d'une collection documentaire de coupures de presse concernant l'histoire locale (hors catalogue);
- d'une collection d'imprimés divers (ephemera, imprimés de circonstance, tracts, programmes), classés chronologiquement.
Les travaux universitaires et travaux de diplômes sont considérés comme des documents d'archives et classés dans la collection des Manuscrits historiques.
Tous les donateurs sont cités dans les rapports annuels d'activité des AEG.